《英雄时代》的主人艾伊吉是以黄金之种族为父体、救生船育成机械为母体养育而成的孩子。艾伊吉可以和英雄之种族中最强的“贝尔克洛斯”“合体”，并能自由使用合体后产生的能力在拯救人类于存亡的关键时刻。话说，各种族为了回应“黄金之种族”的号召，开始向宇宙跨进。而最后踏入宇宙世界成功的种族被人类称为“黑铁之种族”。时光流逝，人类受到了比自己更强大的“白银之种族”的威胁，面临着生死存亡的危机。王女迪雅涅拉为了人类的存续，为了寻回王家代代相传的“黄金之种族”的预言，开始向遥远的银河跋涉，之后她与一个叫艾伊吉的少年相会了。王女与少年的相会完全改变了宇宙的以及整个世界的命运……